Hochdurchsatz-Sequenzierung (High throughput sequencing, HTS) gewinnt in der Medizin immer mehr an Bedeutung, sei es in der biologischen Grundlagenforschung oder in der personalisierten Medizin. HTS ermöglicht die Analyse von millionen DNA-Sequenzen in immer kürzerer Zeit und zu stetig sinkenden Kosten.
Das Praktikum vermittelt Kenntnisse zur Handhabung, Analyse und Interpretation von Sequenzierungsdaten. Im Speziellen behandeln wir die folgenden Themen:
- Datenformate
- Qualitätskontrolle
- Alignment
- ChiP-Seq
- SNP-Calling und Genotypisierung
- Detektion struktureller Varianten
- Detektion von Copynumber-Veränderungen
Das Praktikum besteht aus einem Theorieteil sowie praktischen Übungen am PC, erfordert aber keinerlei Vorkenntnisse in Informatik. Die Übungen finden an Rechnern in unserem Schulungsraum statt.