Die anatomischen Einrichtungen der Universität Münster haben eine lange Tradition und eine große Verpflichtung im Bereich der universitären Lehre. Dies umfasst Vorlesungen, Kurse und Seminare für Studierende der Human- und der Zahnmedizin. Die Lehrveranstaltungen behandeln alle Aspekte der menschlichen Anatomie, einschließlich Allgemeine Anatomie, Gewebelehre, Embryologie und Klinische Anatomie. Die konzeptionellen und organisatorischen Zuständigkeiten für den Un­ter­richt im Gesamtfach Anatomie sind hierbei auf die beiden anatomische Institute sowie auf die Be­triebs­ein­heit Prosektur Anatomie aufgeteilt.
Zusätzlich können Studierende der Medizin oder der naturwissenschaftlichen Fächer in unseren Labors am Institut einen Doktorgrad (M.D./Ph.D.; Ph.D) erlangen, beispielsweise als Teilnehmer eines Graduiertenprogramms.