Das IZKF Münster versteht sich nicht nur als Förderinstrument im Rahmen der leistungsorientierten Mittelvergabe, sondern auch als Technologieplattform innerhalb der Medizinischen Fakultät. So soll ein Teil der Ressourcen zur Strukturverbesserung dienen. Allen Forschungsgruppen wird die Möglichkeit geboten, modernste Technologien für innovative Forschungsprojekte zu nutzen und die Dienstleistungen des IZKF in Anspruch zu nehmen.
Die IZKF Core Unit TRAM wurde am 01.07.2015 in die neue Core Facility TRAnsgenic animal and genetic engineering models (TRAM) des Dekanats überführt.
Leiter: Dr. Dr. Boris Skryabin
Die Core Unit IFG Bioinformatik und Genomik des IZKF und die Core Facility des LIFA wurden am 01.10.2014 zur Core Facility Genomik der Medizinischen Fakultät zusammengelegt.
Leiterin: Univ.-Prof. Dr. Monika Stoll
Einzelzellanalysen identifizieren in der zellbasierten Forschung wichtige neue Informationsebenen: neben dem Verständnis der zellulären Heterogenität von Geweben und der physiologischen Entwicklung von Organen, wird durch Einzelzelltranskritptomanalysen (scRNA-seq) ein tiefes Verständnis der Entstehung von Erkrankungen erzielt. Spatial transcriptomics (ST) liefern wichtige weitere Informationsebenen ergänzend zu scRNA-seq: durch die Integration von ST und scRNA-seq können beispielsweise die zelluläre Heterogenität zu histopathologischen Eigenschaften des Gewebes korreliert werden oder der Einfluss von Zelltypen oder anatomischen Nischen auf Zellprogramme untersucht werden. Dabei kombiniert ST transkriptionelle mit anatomischen Informationen.
Der „CytAssist“ ermöglicht eine standardisierte Prozessierung von ST-Proben durch die automatisierte Platzierung auf ST-CHIPs. Durch diese Standardisierung des Arbeitsschritts, ergeben sich multiple Vorteile gegenüber einer Prozessierung per Hand, wie beispielsweise i.) eine exakte und einfache Platzierung der Probe auf den ST-CHIP; ii.) die Verwendung von Proben, die bereits auf einem Glasträger platziert sind; iii.) Unabhängigkeit von spezialisiertem Personal. ST können in sehr guter Qualität an FFPE Material prozessiert werden, welches ST zu einer attraktiven Technik im Bereich der Einzelzellforschung seltener Erkrankungen macht.
Die Arbeitsgruppe von PD Dr. Kornelius Kerl / Klinik für Pädiatrische Hämatologie und Onkologie konnte im Dezember 2022 aus umgewidmeten IZKF-Mitteln ein Visium CytAssist der Firma 10x Genomics anschaffen. Dieses Gerät steht allen IZKF-Arbeitsgruppen nach einer Einführungsphase zur Verfügung. Bei Interesse für die Verwendung des „CytAssist“ oder bei Einzelzellanalysen im Allgemeinen, melden Sie sich gerne bei PD Dr. Kornelius Kerl.
KONTAKT:
PD Dr. med. Kornelius Kerl
Klinik für Kinder- und Jugendmedizin - Pädiatrische Hämatologie und Onkologie
E-Mail: Kornelius Kerl
Im Rahmen der IZKF „Technology and Methods Service“ wurde am Institut für Pharmakologie und Toxikologie der Servicebereich „Cardiovascular and Cellular Function (CarCeF)“ unter der Leitung von Prof. Dr. med. F. U. Müller eingerichtet. CarCeF stellt im Rahmen von Serviceleistungen ein breites Methodenspektrum zur Verfügung, welches eine umfassende kardiovaskuläre Phänotypisierung genetischer Mausmodelle im Ganztier, im isolierten Organ und auf Zellebene umfasst, aber auch auf nicht kardiovaskuläre Fragestellungen angewendet werden kann.
Es werden auch Methoden fortgeführt, die von der ehemaligen IZKF Core Unit „CarTel“ angeboten wurden. Die von „CarTel“ angebotenen Methoden bleiben somit dem IZKF und der Fakultät erhalten und werden von der neuen Plattform „CarCeF“ konzeptionell und inhaltlich erheblich erweitert.
Weitere Informationen zur Serviceleistung von „CarCeF“ entnehmen Sie bitte dem Flyer.
Mit Hilfe der Lasermikrodissektion lassen sich kleine Bereiche aus Gewebeschnitten und selbst einzelne Zellen unter mikroskopischer Beobachtung ausschneiden. So können diese winzigen isolierten Bereiche dann zum Beispiel mit analytisch-chemischen Verfahren gezielt weiteruntersucht werden. Ein zuvor am IZKF angesiedeltes PALM® CombiSystem der Fa. Zeiss (Foto) wurde kürzlich ansInstitut für Hygiene - Biomedizinische Massenspektrometrie, Robert-Koch-Straße 51 umgezogen. Dort steht es allen Interessierten der Medizinischen Fakultät als IZKF Technologie Angebot, nach Rücksprache, zur Verfügung.
Kontakt:
Institut für Hygiene
- Biomedizinische Massenspektrometrie -
Julian Orthen
Tel.: +49 (0) 251 83-56272
Julian Orthen
Prof. Dr. Klaus Dreisewerd
Tel.: +49 (0) 251 83-56726
Klaus Dreisewerd
Die IZKF-Technologieplattform stellt sich mit den Core Units in einer Broschüre vor. Die Broschüre wird in regelmäßigen Abständen aktualisiert. Neuerungen und Erweiterungen der einzelnen Core Units werden über die Broschüre kommuniziert.
